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Biblioteca (s) :  INIA Treinta y Tres.
Fecha :  21/02/2014
Actualizado :  13/09/2018
Tipo de producción científica :  Artículos en Revistas Indexadas Internacionales
Autor :  NOYES, N.R.; WEINROTH, M.E.; PARKER, J.K.; DEAN, C.J.; LAKIN, S.M.; RAYMOND, R.A.; ROVIRA, P.J.; DOSTER, E.; ABDO, Z.; MARTIN, J.N.; JONES, K.L.; RUIZ, J.; BOUCHER, C.A.; BELK, K.E.; MORLEY, P.S.
Afiliación :  NOELLE R. NOYES; MAGGIE E. WEINROTH; JENNIFER K. PARKER; CHRIS J. DEAN; STEVEN M. LAKIN; ROBERT A. RAYMOND; PABLO JUAN ROVIRA SANZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ENRIQUE DOSTER; ZAID ABDO; JENNIFER N. MARTIN; KENNETH L. JONES; JAIME RUIZ; CHRISTINA A. BOUCHER; KEITH E. BELK; PAUL S. MORLEY.
Título :  Enrichment allows identification of diverse, rate elements in metagenomic resistome-virulome sequencing.
Fecha de publicación :  2017
Fuente / Imprenta :  Microbiome, 2017, 5, p. 142
Páginas :  13 p.
DOI :  10.1186/s40168-017-0361-8
Idioma :  Inglés
Notas :  Article History: Received: 29 May 2017, Accepted: 5 October 2017, Published: 17 October 2017
Contenido :  Background: Shotgun metagenomic sequencing is increasingly utilized as a tool to evaluate ecological-level dynamics of antimicrobial resistance and virulence, in conjunction with microbiome analysis. Interest in use of this method for environmental surveillance of antimicrobial resistance and pathogenic microorganisms is also increasing. In published metagenomic datasets, the total of all resistance- and virulence-related sequences accounts for < 1% of all sequenced DNA, leading to imitations in detection of low-abundance resistome-virulome elements. This study describes the extent and composition of the low-abundance portion of the resistome-virulome, using a bait-capture and enrichment system that incorporates unique molecular indices to count DNA molecules and correct for enrichment bias. Results: The use of the bait-capture and enrichment system significantly increased on-target sequencing of the resistome-virulome, enabling detection of an additional 1441 gene accessions and revealing a low-abundance portion of the resistome-virulome that was more diverse and compositionally different than that detected by more traditional metagenomic assays. The low-abundance portion of the resistome-virulome also contained resistance genes with public health importance, such as extended-spectrum betalactamases, that were not detected using traditional shotgun metagenomic sequencing. In addition, the use of the bait-capture and enrichment system enabled identification of rare resistan... Presentar Todo
Palabras claves :  ANTIMICROBIAL RESISTANCE; METAGENÓMICA; MICROBIAL ECOLOGY; MOLECULAR ENRICHMENT; RARE MICROBIOME; RESISTOME.
Thesagro :  ANALISIS BIOLOGICO; ECOLOGIA MICROBIANA; RESISTENCIA A AGENTES DANINOS.
Asunto categoría :  U30 Métodos de investigación
Marc :  Presentar Marc Completo
Registro original :  INIA Treinta y Tres (TT)
Biblioteca Identificación Origen Tipo / Formato Clasificación Cutter Registro Volumen Estado
TT32862 - 1PXIAP - DDPP/Microbiome/2017Rovira/2

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Biblioteca (s) :  INIA Tacuarembó.
Fecha actual :  05/04/2017
Actualizado :  25/10/2019
Tipo de producción científica :  Documentos
Autor :  CARRACELAS, G.; RICCETTO, S.; ROEL, A.; HUERTAS, R.; VERGER, M.
Afiliación :  JULIO GONZALO CARRACELAS GARRIDO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SARA MAGDALENA RICCETTO AGUIRREZABALA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ALVARO ROEL DELLAZOPPA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; LATU (Laboratorio Tecnológico del Uruguay).
Título :  Manejo de riego y variedades de arroz. Determinación de concentraciones de As en grano, suelo y agua: Paso Farías, Artigas.
Fecha de publicación :  2017
Fuente / Imprenta :  In: Día de Campo, arroz, 7 de febrero, Zona Norte, Paso Farías, Artigas / 8 de febrero, Zona Centro, Pueblo del Barro, Tacuarembó, 2017. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2017.
Páginas :  p. 31-33
Idioma :  Español
Contenido :  Objetivo general: Incorporar al producto arroz un nuevo atributo que, además de sus reconocidas características de calidad y homogeneidad, le agregue valor al certificar la sustentabilidad ambiental de su producción en Uruguay y potencie el mantenimiento de los actuales mercados mundiales, así como la apertura de nuevos mercados y/o nichos de mercados.
Palabras claves :  RICE (ORYZA SATIVA L.).
Thesagro :  ARROZ.
Asunto categoría :  F06 Riego
URL :  http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/13609/1/Arroz-febrero-2017.pdf
Marc :  Presentar Marc Completo
Registro original :  INIA Tacuarembó (TBO)
Biblioteca Identificación Origen Tipo / Formato Clasificación Cutter Registro Volumen Estado
TBO101955 - 1INIPL - PPUY/INIA/ARROZ/TBO/2017
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